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• add_edge() : pele::Graph , pele::NGT
• add_energy_gradient() : pele::BasePotential , pele::SimplePairwiseNeighborList< pairwise_interaction, distance_policy > , pele::AtomListPotential< pairwise_interaction, distance_policy > , pele::SimplePairwisePotential< pairwise_interaction, distance_policy >
• add_energy_gradient_hessian() : pele::BasePotential , pele::SimplePairwisePotential< pairwise_interaction, distance_policy > , pele::AtomListPotential< pairwise_interaction, distance_policy >
• add_in_edge() : pele::Node
• add_node() : pele::Graph
• add_nodes() : pele::Graph
• add_out_edge() : pele::Node
• add_potential() : pele::CombinedPotential
• add_site() : pele::RBTopology
• add_symmetry_rotation() : pele::RigidFragment
• align() : pele::MeasureAngleAxisCluster
• align_all_angle_axis_vectors() : pele::RBTopology
• align_angle_axis_vectors() : pele::RBTopology
• align_path() : pele::RBTopology
• Array() : pele::Array< dtype >
• assign() : pele::Array< dtype > , pele::VecN< N > , pele::MatrixNM< N, M >
• atom2cell() : pele::CellLists< distance_policy >
• atom2xbegin() : pele::CellLists< distance_policy >
• AtomListPotential() : pele::AtomListPotential< pairwise_interaction, distance_policy >