mcpele
1.0.0
The Monte Carlo Python Energy Landscape Explorer
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GaussianCoordsDisplacement() :
mcpele::GaussianCoordsDisplacement
get_accepted_fraction() :
mcpele::MC
get_and_print_elapsed_time() :
mcpele::progress
get_atom_positions() :
pele::CoordsAdaptor
get_committors() :
pele::NGT
get_conf_rejection_fraction() :
mcpele::MC
get_coords() :
pele::CoordsAdaptor
,
mcpele::MC
get_coords_adaptor() :
pele::RBTopology
get_count() :
mcpele::GaussianCoordsDisplacement
,
mcpele::RandomCoordsDisplacement
get_current_percentage() :
mcpele::progress
get_direct_nr_unique_pairs() :
pele::CellIter< distance_policy >
get_E_rejection_fraction() :
mcpele::MC
get_energy() :
pele::RBPotentialWrapper
,
pele::AtomListPotential< pairwise_interaction, distance_policy >
,
pele::BasePotential
,
pele::PairIteratorPotential< pairwise_interaction, distance_policy, pair_iterator >
,
pele::CombinedPotential
,
pele::FrozenPotentialWrapper< PotentialType >
,
pele::BaseHarmonic
,
pele::LowestEigPotential
,
pele::PythonPotential
,
pele::SimplePairwiseNeighborList< pairwise_interaction, distance_policy >
,
pele::SimplePairwisePotential< pairwise_interaction, distance_policy >
,
mcpele::MC
get_energy_gradient() :
pele::BaseHarmonic
,
pele::LowestEigPotential
,
pele::PythonPotential
,
pele::SimplePairwiseNeighborList< pairwise_interaction, distance_policy >
,
pele::SimplePairwisePotential< pairwise_interaction, distance_policy >
,
pele::RBPotentialWrapper
,
pele::BasePotential
,
pele::PairIteratorPotential< pairwise_interaction, distance_policy, pair_iterator >
,
pele::CombinedPotential
,
pele::FrozenPotentialWrapper< PotentialType >
get_energy_gradient_hessian() :
pele::BasePotential
,
pele::PairIteratorPotential< pairwise_interaction, distance_policy, pair_iterator >
,
pele::CombinedPotential
,
pele::FrozenPotentialWrapper< PotentialType >
,
pele::SimplePairwisePotential< pairwise_interaction, distance_policy >
get_entries() :
mcpele::RecordEnergyHistogram
get_entry() :
mcpele::Histogram
get_eqsteps() :
mcpele::RecordEnergyHistogram
,
mcpele::RecordPairDistHistogram< BOXDIM >
get_f() :
pele::Optimizer
,
pele::GradientOptimizer
get_full_coords() :
pele::FrozenCoordsConverter
get_full_grad() :
pele::FrozenCoordsConverter
get_g() :
pele::Optimizer
,
pele::GradientOptimizer
get_H0() :
pele::LBFGS
get_hessian() :
pele::BasePotential
get_hist_gr() :
mcpele::RecordPairDistHistogram< BOXDIM >
get_hist_r() :
mcpele::RecordPairDistHistogram< BOXDIM >
get_histogram() :
mcpele::RecordEnergyHistogram
get_in_edges() :
pele::Node
get_iterations_count() :
mcpele::MC
get_k() :
pele::BaseHarmonic
get_max() :
mcpele::RecordEnergyHistogram
,
pele::Array< dtype >
get_max_acceptance_ratio() :
mcpele::AdaptiveTakeStep
get_maximum_nr_unique_pairs() :
pele::CellIter< distance_policy >
get_maxiter() :
pele::GradientOptimizer
get_maxstep() :
pele::GradientOptimizer
get_mean() :
mcpele::Histogram
,
mcpele::MovingAverageAcc
,
mcpele::RecordEnergyHistogram
get_min() :
mcpele::RecordEnergyHistogram
,
pele::Array< dtype >
get_min_acceptance_ratio() :
mcpele::AdaptiveTakeStep
get_minimum_corner_distance2() :
pele::CellIter< distance_policy >
get_moving_average_mean() :
mcpele::RecordScalarTimeseries
get_moving_average_variance() :
mcpele::RecordScalarTimeseries
get_naccept() :
mcpele::MC
get_neval() :
mcpele::MC
get_nfev() :
pele::Optimizer
,
pele::GradientOptimizer
get_niter() :
pele::Optimizer
,
pele::GradientOptimizer
get_node() :
pele::Graph
get_node_one_minus_P() :
pele::NGT
get_node_P() :
pele::NGT
get_norm_coords() :
mcpele::MC
get_nr_cells() :
pele::CellIter< distance_policy >
get_nr_cellsx() :
pele::CellIter< distance_policy >
get_nr_steps_ma() :
mcpele::MovingAverageAcc
get_nr_unique_pairs() :
pele::HS_WCACellLists< ndim >
,
pele::HS_WCAPeriodicCellLists< ndim >
,
pele::CellIter< distance_policy >
get_nreject() :
mcpele::MC
get_out_edges() :
pele::Node
get_P() :
pele::NGT
get_particle_displ() :
mcpele::GetDisplacementPerParticle
get_pattern() :
mcpele::PatternManager< T >
,
mcpele::TakeStepPattern
get_pattern_direct() :
mcpele::PatternManager< T >
,
mcpele::TakeStepPattern
get_position() :
mcpele::Histogram
get_potential_ptr() :
mcpele::MC
get_PxB() :
pele::NGT
get_rand_particle() :
mcpele::RandomCoordsDisplacementSingle
get_rate_AB() :
pele::NGT
get_rate_AB_SS() :
pele::NGT
get_rate_BA() :
pele::NGT
get_rate_BA_SS() :
pele::NGT
get_rb_position() :
pele::CoordsAdaptor
get_rb_positions() :
pele::CoordsAdaptor
get_rb_rotation() :
pele::CoordsAdaptor
get_rb_rotations() :
pele::CoordsAdaptor
get_recorded_scalar() :
mcpele::RecordDisplacementPerParticleTimeseries
,
mcpele::RecordScalarTimeseries
,
mcpele::RecordEnergyTimeseries
,
mcpele::RecordLowestEValueTimeseries
get_reduced_coords() :
pele::FrozenCoordsConverter
get_reduced_hessian() :
pele::FrozenCoordsConverter
get_report_steps() :
mcpele::MC
get_rij() :
pele::cartesian_distance< ndim >
,
pele::CartesianDistanceWrapper< ndim >
,
pele::periodic_distance< ndim >
,
pele::PeriodicDistanceWrapper< ndim >
,
pele::DistanceInterface
get_rms() :
pele::Optimizer
,
pele::GradientOptimizer
get_seed() :
mcpele::RandomCoordsDisplacement
,
mcpele::ParticlePairSwap
,
mcpele::MetropolisTest
,
mcpele::GaussianCoordsDisplacement
get_sites() :
pele::RBTopology
get_smallest_rij() :
pele::RigidFragment
get_step_ptr() :
mcpele::PatternManager< T >
get_stepsize() :
mcpele::GaussianCoordsDisplacement
,
mcpele::RandomCoordsDisplacement
get_success() :
mcpele::MC
get_successor_edge() :
pele::Node
get_symmetry_rotations() :
pele::RigidFragment
get_takestep() :
mcpele::MC
get_tau() :
pele::NGT
get_temperature() :
mcpele::MC
get_time_series() :
mcpele::RecordScalarTimeseries
get_tol() :
pele::GradientOptimizer
get_trial_coords() :
mcpele::MC
get_trial_energy() :
mcpele::MC
get_variance() :
mcpele::RecordEnergyHistogram
,
mcpele::Histogram
,
mcpele::MovingAverageAcc
get_vecdata() :
mcpele::Histogram
get_vecdata_error() :
mcpele::Histogram
get_vecdata_gr() :
mcpele::PairDistHistogram< BOXDIM >
get_vecdata_normalized() :
mcpele::Histogram
get_vecdata_r() :
mcpele::PairDistHistogram< BOXDIM >
get_weights() :
mcpele::TakeStepProbabilities
get_x() :
pele::GradientOptimizer
,
pele::Optimizer
get_zero_modes() :
pele::RBTopology
GetDisplacementPerParticle() :
mcpele::GetDisplacementPerParticle
GradientOptimizer() :
pele::GradientOptimizer
Graph() :
pele::Graph
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Generated on Thu Dec 11 2014 10:19:56 for mcpele by
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