Index

_

_attempt_exchange() (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method) _BaseMCRunner (class in mcpele.monte_carlo) _broadcast_data() (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method) _close_flush() (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method) _exchange_pairs() (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method) _find_exchange_buddy() (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method) _gather_data() (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method) _gather_energies() (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method)

_initialise() (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method) _MPI_Parallel_Tempering (class in mcpele.parallel_tempering) _point_to_point_exchange_replace() (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method) _print_data() (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method) _print_status() (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method) _scatter_data() (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method) _scatter_single_value() (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method)

A

abort() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) add_accept_test() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) add_action() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method)

add_conf_test() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) add_late_conf_test() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) add_step() (mcpele.monte_carlo.TakeStepPattern method) (mcpele.monte_carlo.TakeStepProbabilities method)

C

CheckSphericalContainer (class in mcpele.monte_carlo)

clear() (mcpele.monte_carlo.RecordDisplacementPerParticleTimeseries method) (mcpele.monte_carlo.RecordEnergyTimeseries method) (mcpele.monte_carlo.RecordLowestEValueTimeseries method)

G

GaussianCoordsDisplacement (class in mcpele.monte_carlo) get_accepted_fraction() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) get_bounds_val() (mcpele.monte_carlo.RecordEnergyHistogram method) get_conf_rejection_fraction() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) get_config() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) get_coords() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) get_count() (mcpele.monte_carlo.GaussianCoordsDisplacement method) (mcpele.monte_carlo.RandomCoordsDisplacement method) get_E_rejection_fraction() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) get_energy() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) get_eqsteps() (mcpele.monte_carlo.RecordPairDistHistogram method) get_hist_gr() (mcpele.monte_carlo.RecordPairDistHistogram method) get_hist_r() (mcpele.monte_carlo.RecordPairDistHistogram method)

get_histogram() (mcpele.monte_carlo.RecordEnergyHistogram method) get_iterations_count() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) get_mean_variance() (mcpele.monte_carlo.RecordEnergyHistogram method) get_neval() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) get_norm_coords() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) get_results() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) get_seed() (mcpele.monte_carlo.GaussianCoordsDisplacement method) (mcpele.monte_carlo.MetropolisTest method) (mcpele.monte_carlo.ParticlePairSwap method) (mcpele.monte_carlo.RandomCoordsDisplacement method) get_status() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) get_stepsize() (mcpele.monte_carlo.GaussianCoordsDisplacement method) (mcpele.monte_carlo.RandomCoordsDisplacement method) get_temperature() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) get_time_series() (mcpele.monte_carlo.RecordDisplacementPerParticleTimeseries method) (mcpele.monte_carlo.RecordEnergyTimeseries method) (mcpele.monte_carlo.RecordLowestEValueTimeseries method)

M

mcpele.monte_carlo (module) mcpele.parallel_tempering (module)

MetropolisTest (class in mcpele.monte_carlo) MPI_PT_RLhandshake (class in mcpele.parallel_tempering)

O

one_iteration() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) (mcpele.parallel_tempering.MPI_PT_RLhandshake method) (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method)

P

ParticlePairSwap (class in mcpele.monte_carlo)

print_terminal() (mcpele.monte_carlo.RecordEnergyHistogram method)

R

RandomCoordsDisplacement (class in mcpele.monte_carlo) RecordDisplacementPerParticleTimeseries (class in mcpele.monte_carlo) RecordEnergyHistogram (class in mcpele.monte_carlo) RecordEnergyTimeseries (class in mcpele.monte_carlo)

RecordLowestEValueTimeseries (class in mcpele.monte_carlo) RecordPairDistHistogram (class in mcpele.monte_carlo) reset_energy() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) run() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) (mcpele.parallel_tempering.MPI_PT_RLhandshake method) (mcpele.parallel_tempering._MPI_Parallel_Tempering method)

S

set_config() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) set_control() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) set_coordinates() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) set_generator_seed() (mcpele.monte_carlo.GaussianCoordsDisplacement method) (mcpele.monte_carlo.MetropolisTest method) (mcpele.monte_carlo.ParticlePairSwap method) (mcpele.monte_carlo.RandomCoordsDisplacement method)

set_report_steps() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) set_takestep() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method) set_temperature() (mcpele.monte_carlo._BaseMCRunner method)

T

TakeStepPattern (class in mcpele.monte_carlo)

TakeStepProbabilities (class in mcpele.monte_carlo)